- Pendidikan berdasarkan Agama (Religious based Education)
Pendidikan berdasarkan agama adalah akar utama dari pendidikan di MTs Yasiska. Ini berarti bahwa setiap mata pelajaran secara universal diusahakan selalu dikaitkan dengan agama. Untuk ini diperlukan kepakaran pada guru bidang studi ( PAI atau non PAI ) untuk melakukan pengkajian setiap bidang studi yang diajarkannya dengan mengkaitkannya secara intelektual dengan filosof agama.
- Pendidikan berdasarkan Kepribadian (Personality based education).
Pendidikan berdasar budaya berarti setiap individu yang berada di zona sekolah harus perilaku secara nyata berbudaya positif, misalkan budaya bersih maka setiap oknum yang berada di zona sekolah (siswa, guru, tamu) harus senantiasa bersikap bersih dengan kata lain sekolah merupakan zona ekslusif pendidikan.
- Pendidikan berdasarkan berfikir sains (Scientific Based Education).
Pendidikan IPTEK yang diterapkan adalah usaha untuk mencetak para calon ilmuan yang berfikir dinamis dan ilmiah, maka orientasi pendidikannya harus aplikasi yang diikuti diskusi dan kajian.